馮智恆畢業於香港演藝學院，師事史家翰，其後遠赴美國進修，入讀曼尼斯音樂學院及耶魯音樂學院，並跟隨迺迪克、大島文子及薛佛林修習單簧管。在學期間，他曾與多位單簧管名家合作演出，包括麥吉爾、威爾遜、克萊寇爾以及史托茲曼。

在演出方面，馮智恆曾於韓國統營國際音樂節、德州音樂節及北美諾福克室樂音樂節中演奏，亦曾在多個重要的演出場地表演，包括紐約卡奈基音樂廳、杜莉音樂廳及林肯中心。他合作過的樂團包括香港小交響樂團、香港管弦樂團、香港創樂團、香港城市室樂團，以及北京國家大劇院管弦樂團。